Alle niet-bibliotheekmaterialen van het KITLV zijn ondergebracht bij de zogenaamde Bijzondere Collecties. Hierbinnen neemt de fotocollectie een prominente plaats in. De meer dan 100.000 foto’s verbeelden een waaier aan onderwerpen.
Zo zijn er onder andere afbeeldingen van het dagelijks leven in Indië, hofcultuur op Java, spoorbruggen, begrafenisrituelen bij de Toraja op Celebes, landbouwculturen op de oostkust van Sumatra, stadgezichten van Paramaribo en de onvermijdelijke tempels op Bali.